TATA DĖŽUTĖ: FUNKCIJOS IR FUNKCIJOS - BIOLOGIJA - 2025

TATA dėžutė , ląstelių biologijos, yra sutariama DNR seka, kuri randama visuose gyvuose organizmuose linijų ir yra plačiai užkonservuoti. Seka yra 5′-TATAAA-3 ′ ir gali sekti keletas pakartotų adeninų.

Nuo transkripcijos pradžios dėžutės vieta yra prieš srovę (arba aukščiau, kaip literatūroje ji dažnai vadinama). Tai yra genų promotoriaus regione, kuriame įvyks sąjunga su transkripcijos veiksniais. Be šių veiksnių, RNR polimerazė II dažnai jungiasi prie TATA dėžės.

RNR polimerazė II. Šaltinis: „Fvasconcellos“, 21:15, 2007 lapkričio 14 (UTC)

Nors TATA dėžutė yra pagrindinė promotoriaus seka, yra genų, kuriems jos trūksta.

charakteristikos

RNR sintezės pradžia reikalauja, kad RNR polimerazė prisijungtų prie specifinių DNR sekų, vadinamų promotoriais. TATA langelis yra promotoriaus sutarimo seka. Prokariotuose jis vadinamas Pribnovo langeliu, o eukariotuose - Goldbergo-Hogneso langeliu.

Taigi TATA dėžutė yra konservuota sritis DNR. Daugelio DNR transkripcijos pradžios regionų sekos nustatymas parodė, kad sutarimo seka arba bendra seka yra (5) T * A * TAAT * (3). Žvaigždute pažymėtos pozicijos yra labai homologiškos. Paskutinis T liekanas visada randamas E. coli promotoriuose.

TATA langelio vieta prokariotuose

Pagal susitarimą bazinėms poroms, kurios atitinka RNR molekulės sintezės pradžią, suteikiami teigiami skaičiai, o bazinėms poroms, buvusioms prieš RNR pradžią, suteikiami neigiami skaičiai. TATA dėžutė yra -10 regione.

E. coli organizme promotoriaus regionas yra tarp -70 ir +30. Šiame regione yra antroji sutarimo seka (5) T * TG * ACA (3) -35 padėtyje. Žvaigždute pažymėtos pozicijos taip pat turi aukštą homologiją.

TATA langelio vieta eukariotuose

Eukariotuose promotoriaus regionai turi signalo elementus, kurie skiriasi kiekvienoje RNR polimerazėje. E. coli pavienė RNR polimerazė identifikuoja signalo elementus promotoriaus srityje.

Be to, eukariotuose promotorių regionai yra labiau paplitę. Yra skirtingos sekos, esančios -30 ir -100 srityje, kurios sukuria skirtingus derinius skirtinguose promotoriuose.

Eukariotuose yra daugybė transkripcijos veiksnių, sąveikaujančių su promotoriais. Pavyzdžiui, faktorius TFIID jungiasi su TATA seka. Kita vertus, ribosomų RNR genai yra susisteminti kelių genų pavidalu, vienas paskui kitą.

-10 ir -35 sričių sutarimo sekų variacijos keičia RNR polimerazės jungimąsi prie promotoriaus srities. Taigi vienos bazės poros mutacija sumažina RNR polimerazės prisijungimo prie promotoriaus sritį.

funkcijos

Vaidmuo transkripcijoje

TATA dėžutė dalyvauja rišant ir inicijuojant transkripciją. E. coli RNR polimerazės holoenzimas yra sudarytas iš penkių α ₂ ββσ subvienetų . Σ subvienetas jungiasi su dviguba grandine DNR ir juda ieškodamas TATA langelio, kuris yra signalas, nurodantis geno pradžią.

Kaip vyksta transkripcija?

RNR polimerazės σ subvienetas turi labai aukštą promotoriaus asociacijos konstantą (eilės tvarka 10 ¹¹ ), o tai rodo aukštą atpažinimo specifiškumą tarp jo ir Pribnovo dėžės sekos.

RNR polimerazė jungiasi prie promotoriaus ir sudaro uždarą kompleksą. Tada jis sudaro atvirą kompleksą, kuriam būdingas 10 bazinių porų DNR dvigubos spiralės vietinis atidarymas. Šis atidarymas palengvėja, nes „Pribnow“ dėžutės seka yra gausi AT.

Kai DNR išvyniota, susidaro pirmieji fosfodiesteriniai ryšiai ir prasideda RNR pailgėjimas. Atleidžiamas σ subvienetas ir RNR polimerazė palieka promotorių. Kitos RNR polimerazės molekulės gali jungtis prie promotoriaus ir pradėti transkripciją. Tokiu būdu geną galima daug kartų perrašyti.

Mielėse RNR polimerazė II susideda iš 12 subvienetų. Šis fermentas inicijuoja transkripciją atpažindamas dviejų rūšių sutarimo sekas sekos transkripcijos pradžios 5ʾ pabaigoje, būtent: TATA konsensuso seka; CAAT sutarimo seka.

Transkripcijos veiksniai

RNR polimerazei II reikalingi baltymai, vadinami TFII transkripcijos faktoriais, kad susidarytų aktyvus transkripcijos kompleksas. Šie veiksniai yra gana konservuoti visuose eukariotuose.

Transkripcijos veiksniai yra baltymo pobūdžio molekulės, galinčios jungtis prie DNR molekulės ir turinčios galimybę padidinti, sumažinti ar panaikinti specifinio geno gamybą. Šis įvykis yra lemiamas genų reguliavimui.

Transkripcijos komplekso susidarymas prasideda nuo TBP baltymo („TATA surišančio baltymo“) prisijungimo prie TATA dėžutės. Savo ruožtu šis baltymas jungiasi su TFIIB, kuris taip pat jungiasi su DNR. TBP-TFIIB kompleksas jungiasi su kitu kompleksu, kurį sudaro TFIIF ir RNR polimerazė II. Tokiu būdu TFIIF padeda RNR polimerazei II prisijungti prie promotoriaus.

Galų gale TFIIE ir TFIIH susilieja ir sukuria uždarą kompleksą. TFIIH yra helikazė ir skatina DNR dvigubų grandžių atskyrimą - procesą, kuriam reikia ATP. Tai atsitinka netoli RNR sintezės pradžios vietos. Tokiu būdu susidaro atviras kompleksas.

Transkripcijos veiksniai ir vėžys

P53 baltymas yra transkripcijos faktorius, dar žinomas kaip p53 naviko slopinimo baltymas. Tai yra dominuojančio onkogeno produktas. Li-Fraumeni sindromą sukelia viena šio mutavusio geno kopija, dėl kurios atsiranda karcinomos, leukemija ir navikai.

Yra žinoma, kad P53 slopina kai kurių genų transkripciją ir suaktyvina kitų. Pavyzdžiui, p53 apsaugo genų transkripciją su TATA promotoriumi, sudarydamas kompleksą, susidedantį iš p53, kitų transkripcijos veiksnių ir TATA promotoriaus. Taigi p53 palaiko ląstelių augimo kontrolę.

Nuorodos

1. Bohinski, R. 1991. Biochemija. Addison-Wesley Iberoamericana, Wilmington, Delaveras.
2. Lodish, H., Berk, A., Zipurski, SL, Matsudaria, P., Baltimore, D., Darnell, J. 2003. Ląstelinė ir molekulinė biologija. Redakcija Médica Panamericana, Buenos Airės.
3. Draugas, S. 1994. P53: žvilgsnis į lėlę už šešėlių žaismo. Mokslas 265: 334.
4. Devlin, TM 2000. Biochemija. Redakcijos reversas, Barselona.
5. Voet, D., Voet, J. 2004. Biochemija. Jonhas Wiley ir sūnūs, Niujorkas.
6. Nelsonas, DL, Cox, MM 2008. Lehningeris - biochemijos principai. WH Freeman, Niujorkas.